氢氰酸是现代*早广泛使用的熏蒸剂之一。氢氰酸可以用于防治各种仓储害虫的各种虫态（除螨类休眠体）。该药动物的毒性强于活性植物的毒性，所以用于对苗木、种子在充分干燥的休眠体的熏蒸是较好的一种熏蒸剂。一般的种子经氢氰酸处理不会影响其发芽率，用氢氰酸处理已休眠的苗木来防除蚧壳虫具有良好的效果，但熏蒸后必须用清水冲洗，以防药害。该药易溶于水，在水中溶解成稀酸，不能安全地用于水果、蔬菜等含水量高的物品。氢氰酸对于许多的贮藏品和粮食、谷物等是常用的一种优良熏蒸剂，许多物体对氢氰酸有强烈的吸附性，如果被熏物品干燥，这种作用是可逆的，由于强烈的吸附性，而使该药的穿透性受到限制，因而建议多采用减压熏蒸。由于氢氰酸对温血动物有剧毒，常作为远洋船灭鼠的药剂。